微生物入侵指外源性微生物经自然或人为途径进入到新生态系统，通过竞争、协同等作用对侵入地的群落组成、结构及功能产生效应的过程。随着农业经济发展，人类及其他动植物等的活动为外源微生物在食物链、环境介质中传播创造了条件，造成外源微生物频繁流动并对土壤生态系统产生扰动，进而引发微生物入侵。
本文基于Web of Science（WoS）核心数据库，结合CiteSpace、VOSviewer等软件，对国内外近20年内（2000—2021年）微生物入侵土壤生态系统的发文数量、主要国家及研究机构、研究学者、学科门类以及关键词聚类等内容进行计量分析，重点关注土壤学领域微生物入侵的研究热点，全面了解外源微生物入侵对植物-土壤生态体系的影响，旨在为培育健康土壤和保障作物安全提供理论支撑。
文献产出趋势表明，微生物入侵研究热点主要集中于有益微生物的植物促生与病害防治功能以及病原微生物入侵对植物与土壤造成生物污染等方面，植物科学成为微生物入侵研究领域文章发表的主要学科。发文国家/地区与机构分析表明在所搜集2000—2021年的文献中，中国科学院发文数量最多，其中南京农业大学与其他机构合作最为密切。此外，本文对论文产出国进行了网络分析，结果显示发文国家中美国与其他国家之间联系最为密切，与中国合作较为密切的国家/地区主要有印度、澳大利亚、巴基斯坦、马来西亚等国。
图1 近二十年前十发文学科占比（a）及文献发表趋势（b）
图2 关键词共现网络分析
文献共被引分析结果表明，现阶段学者的研究热点主要集中于有益菌及病原菌入侵植物-土壤体系的效应。同时，计量软件将文献聚为三类，外源微生物入侵领域的关键词研究热点主要围绕Soil（土壤）、Diversity（多样性）、Growth（生长）等展开，可知当前研究主要关注三个方面：入侵微生物与土著微生物群落的互作（Cluster 1）、土壤微生物入侵机制与影响因子（Cluster 2）、土壤微生物入侵对植物（作物）表型的影响及病害防控机制（Cluster 3）。近年来关注度较高的关键词主要有Biological Control（生物防治）、Rhizosphere Microbiome（根际微生物组）、High-throughput Sequencing（高通量测序）、Metagenomics（宏基因组学）等，这些关键词在一定程度上揭示了该领域当下的研究热点。随着微生物科技手段的进一步发展，极大扩展了学者对植物-土壤体系微生态平衡的理解，近些年来对微生物群落结构功能的研究已逐渐深入，该领域未来研究趋势主要集中于提高有益微生物对植物生长的促进作用以及病原微生物的防控效果等方面。